급성 골수성 백혈병(AML) 연구에 중요한 두 가지 주요 데이터 소스인 TCGA LAML 코호트와 Beat AML 코호트, 그리고 소아 급성골수성 백혈병 코흐트인 TARGET pediatric AML project에 대해 알아보겠습니다.
TCGA LAML 코호트
TCGA LAML 프로젝트는 AML의 유전체 연구를 위한 중요한 자원입니다. 다음은 TCGA LAML 데이터에 접근할 수 있는 주요 웹사이트들입니다:
- 국립 암 연구소 유전체 데이터 커먼즈 (GDC)
- https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LAML
- 원시 유전체 데이터와 임상 정보 제공
- cBioPortal
- https://www.cbioportal.org/study/summary?id=laml_tcga_pub
- 대화형 데이터 탐색 및 시각화 플랫폼
- Broad GDAC Firehose
- https://gdac.broadinstitute.org
- 전처리된 TCGA 데이터 및 자동화된 분석 제공
- 종양 융합 유전자 데이터 포털
- https://tumorfusions.org
- AML의 유전자 융합 탐색에 유용
Beat AML 프로젝트는 또 다른 중요한 AML 연구 자원입니다. 이 코호트는 Tyner et al의 Data Availability 섹션에서 정보를 얻을 수 있습니다. TCGA LAML 코호트와 함께 비교 연구에 사용됩니다.
- Bolouri, H. et al. The molecular landscape of pediatric acute myeloid leukemia reveals recurrent structural alterations and age-specific mutational interactions. Nat. Med. 24, 103–112 (2018).
소아 급성골수성 백혈병 코흐트인 TARGET pediatric AML는 앞서 언급한 GDC [https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TARGET-AML]에서 정보를 추출할 수 있습니다.
결론
TCGA LAML과 Beat AML 코호트, TARGET pediatric AML 프로젝트는 AML 연구를 위한 귀중한 자원입니다. 이러한 데이터셋을 활용함으로써 연구자들은 AML의 유전체 특성에 대한 더 깊은 이해를 얻을 수 있으며, 이는 궁극적으로 진단과 치료 전략 개선으로 이어질 수 있습니다.
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